Doxygen
Die prinzipielle Vorgehensweise für jedes Projekt, was zukünftig mit Doxygen bearbeitet werden soll ist immer gleich:
  • Konfiguration für das konkrete Projekt erstellen
  • Dokumentieren des (vorhandenen) Quelltextes (während der Entwicklung!)
Die Reihenfolge der Schritte spielt keine Rolle, da zu jedem Zeitpunkt eine neue Dokumentation eines Projektes (auch mit geänderter Konfiguration) möglich ist.
Die initiale Konfigurationsdatei wird entweder mit 
doxygen -g
oder über den Wizard (der gleich noch in ein schickes Fenster eingebettet ist) 
doxywizard
erzeugt. Standardmäßig heißt diese Datei "Doxyfile" und sieht etwa so aus.

Zum zweiten Schritt ist unbedingt anzumerken, daß es sich durchaus lohnt, auch völlig unkommentierten Quelltext mit in ein (vorhandenes) Projekt aufzunehmen. Doxygen generiert dann zwar keine ausführlichen Informationen, aber die Dateien, Klassen und Funktionen werden zumindest mit in die Übersicht aufgenommen, und man kann sich einen groben, schnellen Überblick verschaffen!